Кутепов ничем не прославил себя в годы Первой мировой войны. Во время Гражданской войны в Добровольческой армии командовал ротой, Корниловским полком, бригадой, затем Первым армейским корпусом, а в 1919 году — 1-й армией.
В 1920 году стал генералом от инфантерии.
В период эмиграции вначале находился в Белграде, затем перебрался в Париж, где возглавил Российский общевоинской союз (РОВС).
После провала планов, связанных с организацией «Трест», Кутепов не только не оставил своих антисоветских замыслов, но, напротив, активизировал деятельность. Под его руководством велась подготовка офицеров-диверсантов для заброски в СССР, он искал пути для создания в СССР антисоветского подполья.
Учитывая большую опасность, исходившую от РОВС и лично от Кутепова, руководство ОГПУ решило провести операцию по его нейтрализации. Осуществление этой операции было поручено руководителю Особой группы при председателе ОГПУ Якову Серебрянскому.
Материалы данной спецоперации до сих пор засекречены, поэтому есть несколько версий происходившего.
По одним данным, Серебрянский вместе с группой своих боевиков-нелегалов прибыл в Париж 1 января 1930 года, по другим – ещё в августе 1929-го, приступив к подготовке операции сразу после решения советского руководства о «секретном изъятии» Кутепова.
Помимо сотрудников ОГПУ и агентов-нелегалов, в операции участвовали и французы, среди них рамочный мастер Морис Онель и его брат, владелец гаража в Леваллуа-Перре.
Проведение операции было запланировано на воскресенье, 26 января 1930 года, так как, по данным, полученным разведкой, Кутепов в этот день должен был в 11 часов 30 минут утра присутствовать на панихиде по случаю смерти барона Каульбарса в Галлиполийской церкви в Париже на улице Мадемуазель, в 20 минутах ходьбы от его дома.
Накануне, 25 января, одним из сотрудников опергруппы Кутепову была передана записка, в которой ему назначалась кратковременная встреча на пути к церкви. При этом учитывалось, что Кутепов на значимые встречи, которые связаны с агентурной и боевой деятельностью РОВС, постоянно ходил один.
Прождав кое-какое время «курьера» на трамвайной остановке на улице Севр, Кутепов продолжил свой путь к церкви. На улице Удино он был перехвачен опергруппой, представившейся сотрудниками французской полиции, и увезен за город на автомашине. Тем не менее доставить его в Москву и, как рассчитывалось, предать суду не получилось, так как по дороге Кутепов, по свидетельству участников операции, скончался от сердечного приступа.
Принятые полицией и лично начальником контрразведки РОВС полковником Зайцевым меры по выяснению, что же случилось с Кутеповым, положительных результатов не дали. Ближайшее окружение и руководство РОВС терялось в догадках. Находившийся в это время в Париже генерал Штейфон, который в 3 часа дня посетил квартиру Кутепова, написал 27 января 1930 года генералу Геруа в Бухарест:
«Вчера неожиданно при невыясненных обстоятельствах исчез А.П. (Кутепов). Он вышел утром в церковь, никуда не предполагал заходить, никому не назначал свидания и условился с женой, что после обеда (в час дня) они всей семьей отправятся в город».
С. Ю. Рыбас в романе «Генерал Кутепов» утверждает, что Кутепов был тайно захоронен в саду частного дома, принадлежавшего одному из советских разведчиков-нелегалов в пригороде Парижа.
По другой версии, которая была записана со слов участников похищения Ю. П. Власовым и изложенной в его книге «Огненный крест», Кутепова «взяли на женщину» и доставили-таки в Москву.
«Уже будучи на Лубянке, очнувшись, он потребовал кофе».
Дальнейшая судьба генерала Кутепова неизвестна…
Операция по похищению Кутепова, проведенная советской внешней разведкой, нанесла тяжкий удар по белому движению. Депрессия, панические настроения, недоверие к руководителям, взаимные подозрения в сотрудничестве с органами госбезопасности СССР были типичны не только для членов Российского общевоинского союза, но и для поддерживавшей его части белой эмиграции на протяжении ряда лет после исчезновения Кутепова.
Преемником Кутепова на посту председателя РОВС стал генерал-лейтенант Евгений Карлович Миллер, кадровый военный, окончивший в 1892 году академию Генерального штаба.